Sistem penjaminan mutu internal akademi dilaksanakan  Lembaga Penjaminan Mutu Internal  yang bertanggung jawab terhadap mutu akademi yang anggotanya berasal dari akademi. Direktur mengangkat Unit Penjamin Mutul sebagaimana SK Direktur no. 265/A/AKBID-SM/III/2015 tanggal 20 Maret 2015 tentang Unit Penjamin Mutu Akademi Kebidanan Sari Mutiara, dengan struktur sebagai berikut:

Ketua       : Friska Sitorus, SST, M.KM

Proses penjaminan mutu internal merujuk kepada kebijakan mutu (SK Direktur No.270/A/AKBID-SM/VI/2015), manual mutu ((SK Direktur No.271/A/AKBID-SM/VI/2015), standar mutu (SK Direktur No.272/A/AKBID-SM/VI/2015), dan standar kompetensi lulusan (SK Direktur No.273/A/AKBID-SM/VI/2015). Dalam proses penjaminan mutu, Akademi Kebidanan menetapkan 25 (dua puluh lima) standar mutu terdiri dari 8 (delapan) standar pendidikan, 8 (delapan) standar penelitian, 8 (delapan) standar pengabdian kepada masyarakat dan 1 (satu) standar kerjasama dalam dan luar negeri.